رشته‌هاي کارشناسي ارشد شامل زبان و ادبيات فارسي، مهندسي آبياري و زه‌کشي،مهندسي سازه‌هاي آبي و مهندسي مديريت منابع آب مي‌باشد. زمان ثبت نام 5 لغايت 15 بهمن ماه بوده و ثبت نام از طريق سايت اينترنتي مرکز آزمون دانشگاه آزاد اسلاميwww.azmoon.org انجام مي‌شود.